Le protocole de comptage est similaire au comptage nocturne du Cerf.

Pour cette espèce, les chasseurs procèdent à deux types de comptage : des comptages nocturnes et des comptages au brame.
Les comptages nocturnes s’effectuent, tous les ans, entre février et avril à bord d’un véhicule sur plusieurs sites références (représentatifs du milieu de vie des cerfs). Muni d’un puissant phare, les chasseurs tous reliés par talkies-walkies comptabilisent le nombre de cerfs aperçus et en déduisent ainsi l’Indice Kilométrique d’Abondance (IKA).
Pendant la période du brame (trois semaines durant le mois de septembre), les chasseurs investissent là encore des points d’observation stratégiques, à la tombée de la nuit pour comptabiliser cette fois-ci les mâles reproducteurs. L’ensemble de ces résultats permettront alors de définir le nombre de cerfs à prélever afin que l’équilibre naturel soit préservé.

Pour ces oiseaux, il existe deux types de comptage : au printemps et en été. Le premier comptage s’effectue durant la période de reproduction entre avril et mai. Les mâles se mettent à chanter pour attirer les femelles. Ces chants permettent de comptabiliser les effectifs reproducteurs. Pour le Tétras-lyre, les chasseurs écoutent et jumelent. Pour la Bartavelle, ils utilisent des bandes sons pré-enregistrées et recueillent les « réponses ».
Un second comptage a lieu en août, cette fois à l’aide d’un chien d’arrêt qui localisera les nichées et permettra ainsi, aux chasseurs de juger du succès de la reproduction.

Deux saisonnalités et deux méthodes de comptages sont appliqués pour ces espèces dans tous les massifs montagneux.
Pour le Chamois, les comptages s’effectuent courant avril et durant le rut de fin septembre à novembre. Pour le Mouflon, ils se déroulent fin février et de septembre à novembre.
Concernant les méthodes, il s’agit d’un affût et d’une approche combinés. La première consiste à se poster sans bouger dans des sites précis pour observer, compter et évaluer les groupes. La deuxième consiste à cheminer sans bruit sur des itinéraires fréquentés par ces grands animaux.
Ces données permettront là encore de déterminer leurs futurs attributions plans de chasse.

Les techniciens de la FDCI et le personnel de l’Office National de la Chasse et de la Faune Sauvage (ONCFS) participent, depuis 18 ans, à des comptages ACT (Alaudidés Columbidés Turdidés tels que les grives, les merles, les tourterelles et les alouettes) au niveau national. Les sorties, au nombre de trois par an, permettent  de préciser les tendances démographiques des oiseaux mais aussi de définir leurs statuts : oiseaux nicheurs, de passage ou hivernants. Ces comptages s’appliquent à différentes périodes, horaires et espèces. Ils se déroulent sur 15 routes à raison de 5 points d’écoute chacune. Au mois de janvier, les comptages dits « flash » ont lieu de 10h à 12h pour une durée maximale d’écoute et d’observation de 5 minutes par poste. En avril et en mai, les comptages s’effectuent une heure après le lever du soleil pour une durée maximale de 10 minutes. Les résultats obtenus permettent d’alimenter une base de données européenne : STOC (Suivi Temporel des Oiseaux Communs) régit par le Centre de Recherches par le Baguage des Populations d’Oiseaux.