Deux saisonnalités et deux méthodes de comptages sont appliqués pour ces espèces dans tous les massifs montagneux.
Pour le Chamois, les comptages s’effectuent courant avril et durant le rut de fin septembre à novembre. Pour le Mouflon, ils se déroulent fin février et de septembre à novembre.
Concernant les méthodes, il s’agit d’un affût et d’une approche combinés. La première consiste à se poster sans bouger dans des sites précis pour observer, compter et évaluer les groupes. La deuxième consiste à cheminer sans bruit sur des itinéraires fréquentés par ces grands animaux.
Ces données permettront là encore de déterminer leurs futurs attributions plans de chasse.

Les techniciens de la FDCI et le personnel de l’Office National de la Chasse et de la Faune Sauvage (ONCFS) participent, depuis 18 ans, à des comptages ACT (Alaudidés Columbidés Turdidés tels que les grives, les merles, les tourterelles et les alouettes) au niveau national. Les sorties, au nombre de trois par an, permettent  de préciser les tendances démographiques des oiseaux mais aussi de définir leurs statuts : oiseaux nicheurs, de passage ou hivernants. Ces comptages s’appliquent à différentes périodes, horaires et espèces. Ils se déroulent sur 15 routes à raison de 5 points d’écoute chacune. Au mois de janvier, les comptages dits « flash » ont lieu de 10h à 12h pour une durée maximale d’écoute et d’observation de 5 minutes par poste. En avril et en mai, les comptages s’effectuent une heure après le lever du soleil pour une durée maximale de 10 minutes. Les résultats obtenus permettent d’alimenter une base de données européenne : STOC (Suivi Temporel des Oiseaux Communs) régit par le Centre de Recherches par le Baguage des Populations d’Oiseaux.